Linux i Windows?! naravno da idu zajedno. što se tiče particija najbitnije ti je da jednu particiju koja ti je predviđena za linux formatiraš u partition manageru kao linux ext3. na tu particiju kasije instaliraš linux. ta particija ne mora biti c: particija, bolje je da na c: particiju instaliraš windowse. što se same instalacije tiče preporučam da linux instaliraš nakon windowsa jer u suprotnom nećeš moći podići linux (hoćeš ali postoje male komplikacije). dakle nakon što su windowsi gore, ubaciš linux cd, restartaš komp i bootaš linux sa cd-a. neke distribucije se instaliraju tek kad se sustav podigne klikom na dotičnu ikonicu, a neke prilikom butanja ponude instalaciju ili bootanje sa cd-a. kasnije samo pratiš instalaciju kao kod windowsa.
ps. ne preporučam knopix jer je jednom riječju smeće. od jednostavnijih distribucija možeš isprobati mandrivu one 2008 ili xubuntu. mandriva ima sve potrebne codece i sve fino glatko radi. odustani od knopix-a.