Ja sam imao takav slučaj na popravku, zadnji test koji sam radio je bio sa HDD Regeneratorom (mislim da demo verzija može napraviti provjeru cijelog diska) i tu se tek pokazalo da ima loše sektore na mjestima gdje se nije isplatilo odvajati prostor brisanjem particije.
Ako nađe loše na samom početku diska i dalje ne, taj dio+bar 500MB dalje ostavi kao obrisanu particiju a ostatak se još može koristiti bez problema jer imam jedan takav u pogonu i još uvijek radi bez problema.

U svakom slučaju ne gine ponovna instalacija windoza jer se ne isplati toliko vremena zafrkavati sa popravkom oštećenih, to iz iskustva znam
I naravno sad naaajprije napravi backup svega bitnog sa diska a onda nek operacije počnu jer nikad se ne zna.