Ne brkati AHCI i IDE mod sa samim diskom, to dvoje ne ovisi jedno o drugom i svi diskovi rade u oba moda. Linux vjerojatno ima bolje drivere u sebi pa zato "preživi" takvu promjenu, ali su Widnowsi poprilično glup OS pa treba raditi razne trikove.

Vrati kontroler u AHCI mod, odi u Windowse, otvori regedit i nađi jedan od ova dva foldera (možda čak imaš i oba):

HKEY_LOCAL_MACHINE\System\CurrentControlSet\Servic es\Msahci
HKEY_LOCAL_MACHINE\System\CurrentControlSet\Servic es\IastorV

S desne strane imaš vrijednost Start koja ti je sad vjerojatno 0 i ti ćeš je promijeniti u 3. Nakon toga odi u BIOS, prebaci kontroler u IDE mod i trebalo bi raditi.