Odi na:
C:\Documents and Settings\USER\Aplication Data\Thunderbird\Profile

i izbriši sve profile (ili ih backupiraj negdje, bitno samo da nisu u tom folderu)

Odi desni klik na ikonu od thunderbirda i u path dodaj " -profilemanager" (bez navodnika)
trebalo bi izgledati ovako:
"c:\..........\thunderbird.exe" -profilemanager

Sada kreiraj novi profil i stavi ga na default, thunderbird bi se trebao normalno upaliti. Kad sve podesiš možeš maknuti iz patha onaj -profilemanager i tada će ti se Thunderbird startati normalno.