jar file je 'java archive' file i u njemu se zapakirane nalaze kompajlirane klase, odnosno java byte code... jar file je u stvari aplikacija (odnosno njeni dijelovi, zapakirani u jedan fajl, vrlo vjerojatno nekomprimiran).

a kaj je jad? nisam to sreo još, možda kakav self-decompressing file... nešto tipa instalacijski.. ali za jar sam siguran kaj je...